25 января 1867 г. Ма Шэн направил к Баркулю 2-тысячный конный отряд. В течение двух дней повстанцы штурмовали городскую крепость, но взять ее не смогли. На третий день на помощь гарнизону подошли китайские отряды туаньлянь во главе с Чэнь Шэн-хэном, Жуй Линем, Чжан Хэ и Чжао Пу. Восставшие были вынуждены прекратить штурм крепости и отступить обратно в Комул . После этой неудачной попытки Ма Шэн отложил военный поход на Баркуль до весны.
Освобождением Комула повстанцы вновь отрезали Баркуль от Ганьсу, лишили его продовольственного обеспечения из внутреннего Китая и, главное, сорвали переброску в Комул и Баркуль войск генерала Чэн Лу. В создавшихся условиях цинские власти для укрепления своего положения в Баркуле предприняли энергичные меры по организации отрядов туаньлянь из местных и бежавших из Цитайской и Комулской областей китайцев и маньчжуров. К службе в них были привлечены и 600 уйгуров, проживавших в районе Дуншань (Комулское княжество) . Предпринимая подобный шаг, администрация помимо усиления своих воинских формирований рассчитывала породить неприязнь между дунганами и уйгурами. Общая численность отрядов «самообороны» была доведена до 2700 человек. Кроме того, в Баркуль были стянуты ту-аньляни, действовавшие вблизи Баркульской области. 24 марта 1867 г. сконцентрированная в Баркуле 5—6-тысячная армия начала поход на Комул.
Силы не ожидавших нападения повстанцев в этом городе были серьезно ослаблены посылкой крупного отряда на помощь Сучжоу (по поступившей оттуда просьбе). Оставшиеся в Комуле части повстанцев не смогли отбить последовавший 30 марта штурм превосходившей их по численности маньчжуро-китайской армии (ею командовали Жуй Линь и Чжао Вань-хай). Оставив город, восставшие отступили в район Убао, а оттуда, разделившись на две группы, ушли на запад, в сторону Турфана . Покидая Комул, они разграбили имущество чиновников, помещиков и ростовщиков .
